对于从事基因研究的科研人员，这套数据库组合堪称 “全流程工具箱”。从基因的基础信息、转录本结构与基因组注释，到批量提取和启动子、ChIP-seq 分析，NCBI Gene、Ensembl 与 UCSC 帮您把 “基因是什么” 彻底吃透；当需要表达证据时，GEO 与 GEO2R 让公共转录组差异分析唾手可得，GTEx 提供正常组织基线，而 GDC/TCGA、GEPIA2、UALCAN 则把癌症多组学、表达、预后与甲基化分析一网打尽。蛋白层面，HPA 与 UniProt 衔接 “基因 — 蛋白” 的证据链；再借助 STRING 构建蛋白互作网络，g:Profiler 与 MSigDB 完成 GO、通路及 GSEA 富集，cBioPortal 深挖突变图谱。从序列到表达、蛋白到功能、互作到富集，这条 “基因研究流水线” 能显著提升您的分析效率与证据厚度，值得收藏。
| 数据库 | 主要用途 | 官方网址 |
|---|---|---|
| NCBI Gene | 基因基础信息 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/ |
| Ensembl | 基因结构、转录本 | https://www.ensembl.org/ |
| Ensembl BioMart | 批量提取基因信息 | https://www.ensembl.org/biomart/martview |
| UCSC | 基因组、启动子、ChIP-seq | https://genome.ucsc.edu/ |
| GEO | 公共转录组数据 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ |
| GEO2R | GEO在线差异分析 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/ |
| GTEx | 正常组织表达 | https://gtexportal.org/ |
| GDC/TCGA | 癌症多组学数据 | https://portal.gdc.cancer.gov/ |
| GEPIA2 | TCGA+GTEx在线分析 | http://gepia2.cancer-pku.cn/ |
| UALCAN | 表达、预后、甲基化、蛋白 | https://ualcan.path.uab.edu/ |
| HPA | 蛋白表达、IHC、定位 | https://www.proteinatlas.org/ |
| UniProt | 蛋白功能和序列 | https://www.uniprot.org/ |
| STRING | PPI蛋白互作 | https://string-db.org/ |
| g:Profiler | GO和通路富集 | https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/ |
| MSigDB | GSEA基因集 | https://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/ |
| cBioPortal | 癌症突变和多组学 | https://www.cbioportal.org/ |